Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim6Q8BGE7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim6Q8BGE7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim6Q8BGE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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