Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pknox2Q8BG99 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms