Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpp38Q80UU2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpp38Q80UU2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms