Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ube3cQ80U95 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3cQ80U95 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3cQ80U95 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms