Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo1Q7TT28 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo1Q7TT28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo1Q7TT28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo1Q7TT28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo1Q7TT28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo1Q7TT28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rexo1Q7TT28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo1Q7TT28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo1Q7TT28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms