Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atf7ipQ7TT18 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atf7ipQ7TT18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atf7ipQ7TT18 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf7ipQ7TT18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms