Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf139Q7TMV1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf139Q7TMV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf139Q7TMV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms