Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uhrf2Q7TMI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uhrf2Q7TMI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms