Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17leQ7M764 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17leQ7M764 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17leQ7M764 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17leQ7M764 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17leQ7M764 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17leQ7M764 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17leQ7M764 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp17leQ7M764 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp17leQ7M764 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms