Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy1Q76LS9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mindy1Q76LS9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mindy1Q76LS9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy1Q76LS9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms