Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2d2bQ6ZWY6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d2bQ6ZWY6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2d2bQ6ZWY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms