Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy1Q6ZQ11 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy1Q6ZQ11 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy1Q6ZQ11 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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