Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300lfQ6SJQ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300lfQ6SJQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300lfQ6SJQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms