Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcaf3Q6QR59 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcaf3Q6QR59 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcaf3Q6QR59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms