Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Herc4Q6PAV2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Herc4Q6PAV2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Herc4Q6PAV2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms