Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcrQ6PAJ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BcrQ6PAJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcrQ6PAJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BcrQ6PAJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms