Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NesQ6P5H2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NesQ6P5H2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NesQ6P5H2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NesQ6P5H2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms