Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podnl1Q6P3Y9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Podnl1Q6P3Y9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Podnl1Q6P3Y9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Podnl1Q6P3Y9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms