Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrimpolQ6P1E7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrimpolQ6P1E7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms