Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt40Q6IFX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt40Q6IFX3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt40Q6IFX3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms