Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrcc1Q69ZB0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrcc1Q69ZB0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms