Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cntn4Q69Z26 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cntn4Q69Z26 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cntn4Q69Z26 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms