Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab3ipQ68EF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab3ipQ68EF0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms