Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PatjQ63ZW7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PatjQ63ZW7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms