Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3gl2Q62420 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3gl2Q62420 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3gl2Q62420 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3gl2Q62420 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3gl2Q62420 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3gl2Q62420 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3gl2Q62420 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3gl2Q62420 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3gl2Q62420 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3gl2Q62420 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms