Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Npm1Q61937 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Npm1Q61937 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Npm1Q61937 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Npm1Q61937 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Npm1Q61937 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms