Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde3bQ61409 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde3bQ61409 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms