Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1eQ61290 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1eQ61290 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cacna1eQ61290 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1eQ61290 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms