Protein–RNA interactions for Protein: Q61288

Acvrl1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvrl1Q61288 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acvrl1Q61288 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acvrl1Q61288 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acvrl1Q61288 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms