Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a1Q61165 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms