Protein–RNA interactions for Protein: Q60967

Papss1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papss1Q60967 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Papss1Q60967 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Papss1Q60967 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Papss1Q60967 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Papss1Q60967 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms