Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DbpQ60925 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbpQ60925 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbpQ60925 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbpQ60925 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms