Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf3Q60765 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atf3Q60765 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Atf3Q60765 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms