Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mkrn3Q60764 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mkrn3Q60764 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mkrn3Q60764 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms