Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf123Q5XPI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf123Q5XPI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms