Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms