Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uimc1Q5U5Q9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uimc1Q5U5Q9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uimc1Q5U5Q9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms