Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Trim38Q5SZ99 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim38Q5SZ99 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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