Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc42Q5SV66 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms