Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps54Q5SPW0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps54Q5SPW0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps54Q5SPW0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps54Q5SPW0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps54Q5SPW0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps54Q5SPW0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps54Q5SPW0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps54Q5SPW0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms