Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spsb3Q571F5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spsb3Q571F5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spsb3Q571F5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms