Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clul1Q3ZRW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clul1Q3ZRW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clul1Q3ZRW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clul1Q3ZRW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms