Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2Q3V1H1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2Q3V1H1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms