Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms