Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp560Q3URI6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp560Q3URI6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms