Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rmi2Q3UPE3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rmi2Q3UPE3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rmi2Q3UPE3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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