Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem253Q3UNB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem253Q3UNB8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem253Q3UNB8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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