Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smu1Q3UKJ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smu1Q3UKJ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms