Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx27Q3UHD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx27Q3UHD6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx27Q3UHD6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx27Q3UHD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms