Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pid1Q3UBG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pid1Q3UBG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pid1Q3UBG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms